Уважаемый Роман Анатольевич, насколько я понимаю, администрация Вашего прежнего места работы в данном случае права, так как согласно п.1 ст.83 Трудового Кодекса Российской Федерации призыв работника на военную службу или направление его на заменяющую ее альтернативную гражданскую службу является обстоятельством прекращения трудового договора.